不過，愛媛縣干部質(zhì)疑學(xué)園方面的主張。在野黨也齊聲批評這是袒護(hù)安倍的牽強(qiáng)辯白，打算以查明真相離不開傳喚當(dāng)事人加計(jì)到國會(huì)作證為由加強(qiáng)追究。在此之前，安倍已經(jīng)在國會(huì)否認(rèn)與加計(jì)會(huì)面，但沒有表明具體依據(jù)。

愛媛縣向國會(huì)提交的新文件顯示，安倍與加計(jì)在2015年2月25日進(jìn)行了約15分鐘的會(huì)面。文件中寫道，加計(jì)介紹稱，力爭開展具有國際水平的獸醫(yī)學(xué)教育，安倍評論稱“這種新獸醫(yī)大學(xué)的想法很好”。該縣稱，于同年3月3日從學(xué)園相關(guān)人士處接到報(bào)告。

學(xué)園發(fā)表的評論解釋稱，就新文件內(nèi)容向相關(guān)人士進(jìn)行確認(rèn)，結(jié)果得知“負(fù)責(zé)人將實(shí)際不存在的安倍總理與加計(jì)理事長的會(huì)面當(dāng)作話題提出，向愛媛縣和今治市傳達(dá)了錯(cuò)誤信息”。

關(guān)于傳達(dá)虛假會(huì)面信息的理由，據(jù)悉是因?yàn)楫?dāng)時(shí)新設(shè)獸醫(yī)系的計(jì)劃陷入停滯，認(rèn)為“在探尋解決辦法的情況下，從‘結(jié)構(gòu)改革特區(qū)’轉(zhuǎn)向‘國家戰(zhàn)略特區(qū)’的話，或許能找到出路”。學(xué)園相關(guān)人士解釋稱“干部并不知情”，表示今后將考慮對涉事職員予以處分。

愛媛縣新文件的記載還包括“學(xué)園理事長與總理見面后，接到秘書官要求提交材料的指示”、“總理與學(xué)園理事長日前聚餐”，但學(xué)園的評論并未提及這些記載。

加計(jì)學(xué)園通過傳真向媒體發(fā)送了1頁紙的評論，道歉稱“給相關(guān)人士添麻煩了”，但沒有召開記者會(huì)。愛媛縣干部認(rèn)為存在抵賴的可能性，表示“將加緊收集信息”。

愛媛縣于21日向國會(huì)提交了新文件。安倍在22日的國會(huì)上強(qiáng)調(diào)“沒有在被指出的那天會(huì)面”、“沒有談?wù)撔略O(shè)獸醫(yī)系”，稱獲悉計(jì)劃的時(shí)間為2017年1月20日。今治市市長菅良二25日表示：“記得接到報(bào)告稱理事長與首相會(huì)面了?！?/p>