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新技術(shù)能窺探更細(xì)微基因變異

2017年04月18日 11:02 | 來(lái)源:健康報(bào)網(wǎng)
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中美研究人員在新一期美國(guó)《科學(xué)》雜志上報(bào)告說(shuō),他們研制出一種新型單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù),在此基礎(chǔ)上不僅有望避免許多遺傳性疾病遺傳給后代,從基因組角度更深入地認(rèn)識(shí)癌癥也將成為可能。

單細(xì)胞研究是當(dāng)前生命科學(xué)研究的重要方向之一。許多關(guān)鍵的生命活動(dòng)都和細(xì)胞間個(gè)體差異密切相關(guān);許多重要的生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)問(wèn)題所能依賴的樣品往往也是極少數(shù)細(xì)胞。但在相關(guān)研究中,由于單個(gè)細(xì)胞中的DNA(脫氧核糖核酸)的含量極少,先需要通過(guò)全基因組擴(kuò)增技術(shù)將DNA進(jìn)行擴(kuò)增,從而便于單細(xì)胞測(cè)序。

最新單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)名為L(zhǎng)IANTI,由美國(guó)科學(xué)院院士謝曉亮教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)經(jīng)4年努力研發(fā)而成。謝曉亮同時(shí)在哈佛大學(xué)和北京大學(xué)任職。他告訴記者,跟以往的技術(shù)相比,新技術(shù)在所有指標(biāo)上都有大幅度提高,讓單細(xì)胞擴(kuò)增與測(cè)序更加精準(zhǔn)。

首先,單細(xì)胞基因組經(jīng)LIANTI技術(shù)放大后,“噪音”非常小,這使測(cè)量基因拷貝數(shù)的精確度非常高。拷貝數(shù)是指某基因在基因組中的個(gè)數(shù)。人的體細(xì)胞內(nèi)基因拷貝數(shù)一般是兩個(gè),分別來(lái)自父母,但在癌癥中基因拷貝數(shù)有可能變多或變少,在遺傳疾病中甚至有時(shí)缺失。許多癌癥和遺傳病都與拷貝數(shù)變異有關(guān)。

謝曉亮說(shuō),新技術(shù)使得測(cè)量拷貝數(shù)的空間分辨率提高了3個(gè)數(shù)量級(jí),由此能查出基因組上以前查不出來(lái)的一些小段堿基微缺失。這意味著能更有效、更精準(zhǔn)地檢測(cè)出更多遺傳疾病。

其次,測(cè)單堿基突變的靈敏度大大增強(qiáng)。單堿基突變是指基因組上只有一個(gè)堿基突變,它同樣有可能導(dǎo)致癌癥與遺傳病。

第三,新技術(shù)測(cè)量基因組的覆蓋率達(dá)到97%。也就是說(shuō),一個(gè)細(xì)胞基因組里97%的堿基可以測(cè)到。

謝曉亮說(shuō),LIANTI技術(shù)跟PCR(聚合酶鏈反應(yīng))技術(shù)類似,但不同的是,前者放大的不是單個(gè)基因,而是整個(gè)基因組。與PCR技術(shù)的指數(shù)放大方法相比,LIANTI技術(shù)的線性放大方法減少了“噪音”與錯(cuò)誤。PCR技術(shù)是上世紀(jì)80年代發(fā)展起來(lái)的,其發(fā)明人因此獲得1993年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

對(duì)于新技術(shù)的意義,謝曉亮說(shuō),人的基因組時(shí)刻在變化,LIANTI技術(shù)使人們能了解細(xì)胞基因組怎樣隨時(shí)間推移而變化。臨床方面,可以用它來(lái)篩選沒有遺傳疾病的受精卵,從而幫助許多夫妻獲得健康后代;這項(xiàng)技術(shù)能在單細(xì)胞上看基因突變,對(duì)了解癌癥也非常重要。(記者林小春)

編輯:趙彥

關(guān)鍵詞:新技術(shù) 窺探更細(xì)微 基因變異

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